
Kota Kotamobagu terletak di ketinggian antara 180 - 130 meter diatas permukaan laut (dpl). Posisi Kota Kotamobagu berada di sebuah lembah yang dikelilingi pegunungan dan dilewati beberapa sungai, antara lain sungai Bonodon, sungai Yoyak, dan sungai Motoboi Besar di Kotamobagu Timur; sungai Yantaton dan sungai Kopek di Kotamobagu Selatan; sungai Kelurahan Mongkonai dan sungai Ongkaw Mongondow di Kotamobagu Barat; sungai Bilalang, sungai Toko dan sungai Kotobangon di Kotamobagu Utara.
Pemerintahan Kota - Wilayah administrasi pemerintahan Kota Kotamobagu tahun 2013 terdiri atas 4 kecamatan, 15 desa dan 18 kelurahan. Adapun pembagian wilayah administrasi pemerintahan kecamatan, yaitu:
Kotamobagu Utara terdiri atas:
Kotamobagu Timur terdiri atas:
Kotamobagu Selatan terdiri atas:
Kotamobagu Barat terdiri atas:
Pada Pemilu Legislatif 2014 lalu, DPRD Kota Kotamobagu berjumlah 25 orang dengan perwakilan delapan partai politik.
Kependudukan dan Tenaga Kerja. Pada tahun 2012 jumlah penduduk laki-laki di Kota Kotamobagu sebanyak 55.415 atau 50,94% dan penduduk perempuan sebanyak 53.379 atau 49,06%. Tingkat Partisipasi Angkatan Kerja (TPAK) pada tahun 2009 58,39%, tahun 2010 61,82%, tahun 2011 67,02%, tahun 2012 65,07%. Tahun 2012 , dari total 78.434 penduduk Kota Kotamobagu yang berada dalam kelompok usia kerja 15 tahun keatas, sebanyak 65,07% merupakan angkatan kerja. Dari jumlah angkatan kerja tersebut 90,58% berstatus bekerja, sedangkan sekitar 9,42% menganggur.
Untuk SD tahun 2011 berjumlah 74 gedung sekolah, murid sebanyak 13.365 orang. Untuk SLTP tahun 2011 berjumlah 16 gedung sekolah, murid sebanyak 7.035 orang. Untuk SLTA tahun 2011 berjumlah 21 gedung sekolah, murid sebanyak 8.514 orang. Tahun 2012 jumlah fasilitas kesehatan terdiri dari Rumah Sakit 6 Unit, Puskesmas 5 unit, Puskesmas Pembantu 7 Unit, Puskesmas Keliling 5 Unit, Puskesmas Rawat Inap 3 Unit, Posyandu 45 Unit. Dan Angka Harapan Hidup pada tahun 2012 sebesar 72,12%.